La Delegación Provincial de la Agricultura tiene la Misión de ejercer el control del cumplimiento de las políticas del Estado y Gobierno en la Provincia sobre la producción Agropecuaria y Forestal, propiedad y posesión de la tierra y su empleo sostenible ,uso, conservación y mejoramiento de los suelos, sanidad vegetal y animal, registro y control estadístico del patrimonio ganadero, control del patrimonio forestal y flora y fauna silvestre, mecanización, riego y drenaje agrícola, genética animal y recursos zoogenéticos, semillas y recursos filogenéticos y fomento y desarrollo del movimiento cooperativo en el sector agropecuario y azucarero.

Está integrada por: el Delegado, la Secretaría del Delegado, 3 Subdelegados, 13 Departamentos independientes, 3 secciones.

La estructura es como sigue:

• DIRECCIÓN (DELEGADO, SECRETARÍA Y ATENCIÓN A LA POBLACIÓN)
• SUBDELEGADOS
• SECCIÓN DE CUADROS
• SECCIÓN JURÍDICA
• DPTO. DE AUDITORÍA
• DPTO. DE DEFENSA Y SEG. Y PROTECCIÓN
• DPTO. CONTROL TIERRA Y SUELOS
• DPTO. SANIDAD VEGETAL
• DPTO. SANIDAD ANIMAL
• DPTO. GENÉTICA ANIMAL Y CONTROL PECUARIO
• DPTO. INGENIERÍA AGROPECUARIA
• DPTO. FORESTAL, FLORA Y FAUNA SILVESTRE
• DPTO. DE DESARROLLO Y FOMENTO COOPERATIVO
• DPTO. DE RECURSOS FITOGENÉTICOS Y SEMILLAS
• DPTO. DE GANADERÍA
• DPTO. AGRÍCOLA Y AUSU
• SECCIÓN DE COMERCIALIZACIÓN
• DPTO. DE ECONOMÍA
• DPTO. DE PERSONAL
• DPTO. CIENCIA, DESARROLLO Y MEDIO AMBIENTE
• PUESTO DE DIRECCIÓN
• DPTO. DE INSPECCIÓN

Además se le anexan en la actividad de servicios:

• 1 Laboratorio de Protección de Plantas
• 1 Puesto en frontera

Tiene 9 Delegaciones Municipales en los diferentes municipios (Manuel Tames, El Salvador, Niceto Pérez, Guantánamo, Yateras, Imías, San Antonio del Sur, Maísi, Baracoa).